Há mais de duas décadas, em meados de 1998, o Instituto Educacional Portal do Saber, também conhecido como "Portal do Saber", foi adquirido e reestruturado na cidade de Juína, Mato Grosso. A carência de ensino superior na região levou à busca por uma instituição parceira. Em 2002, após inúmeras tentativas, um convênio foi estabelecido, dando origem à Associação Juinense de Ensino Superior do Vale do Juruena (AJES). A AJES obteve autorização para oferecer cursos de Ciências Contábeis e Letras em 2005.

A instituição expandiu seus programas de pesquisa e criou iniciativas de apoio a estudantes de baixa renda, como o Fundo de Apoio ao Acadêmico do Ensino Superior (FAAES) e o Projeto "Vem-Ser". Em 2009, novos cursos na área de saúde, como Enfermagem, Fisioterapia e Psicologia, foram introduzidos. Finalmente, em 2018, ocorreu a unificação do Instituto Superior de Educação e da Faculdade de Ciências Contábeis e Administração do Vale do Juruena, formando a Faculdade do Vale do Juruena.

A AJES desempenha um papel vital na educação e no desenvolvimento de Juína, oferecendo uma variedade de cursos e oportunidades para estudantes locais, ao mesmo tempo que contribui para o progresso econômico e social da região.